【Python】医療AI基盤構築におけるデータ管理・品質検証担当の案件・求人【エッジテクノロジー株式会社】

案件情報

• 業務内容

  作業内容	◼︎本ポジションについて 領域特化型AI基盤モデルの研究成果を、医療機関向けの商用検査サービスとして社会実装するフェーズにあります。 本ポジションは、この間に立ち、データの受領から品質検証、研究開発への受け渡しまでを専門性をもって担っていただく役割です。 このポジションの中心は、「このデータを受け取っていいのか」を判断できることです。リード数や品質スコアだけでなく、変換効率の低下やDNA分解、バッチ間のずれといった異常に気づけることが求められます。ここを見逃すと、そのままモデル開発に流れ込みます。現状はデータの中身が分かる人がいないと判断できない状態ですが、条件が構造化されて記録されていれば、次の担当者は経験がなくても異常を検知できます。 ◼︎職務内容 - 受託解析機関・シーケンス受託先からのデータ受領（クラウドストレージ、専用回線等） - 転送の完全性検証（ハッシュ値照合、ファイル数・サイズの照合） - 一次品質評価（リード数、品質指標分布、マッピング率、重複率、変換効率などの基本品質指標の確認） - 基準を外れた場合の、委託先への差し戻し判断 - 許容範囲をご自身で判断すること（研究開発側に判断を委ねない） - サンプルIDと解析データIDの対応関係の管理、およびID変換処理の運用（現在IT部門が担っている部分の引き取り） - サンプル管理担当が保持する検体情報と、データ側のメタデータの整合性確保 - メタデータ項目の設計（実験条件、ライブラリ調製条件、シーケンス条件、変換手法など） - 後から異常の原因を追えるように、条件を構造化して残すこと - 解析プラットフォーム周りの運用（アカウント設計、実行設定、出力の確認） - データ転送の運用（ネットワーク構築自体はIT部門が担当。転送量・タイミングの相談は連携して実施） - ソフトウェアがエラーで停止したときの一次対応と切り分け - ストレージ構成、ディレクトリ構造、命名規則、バージョン管理、保管期間・アーカイブ方針の設計 - 研究開発メンバー・モデル開発チームへのデータ提供 - アクセス権限管理の運用（IT部門と連携） - 受領から研究開発提供までの処理の手順化・自動化 - IT部門が検討するサンプルトラッキングシステムに対する、データ側の要件定義への参画
  必須スキル	- 配列データの取扱実務経験（3年以上、標準フォーマット、品質評価、一次処理） - データの異常が「なぜ起きたか」を切り分けられること（変換効率の低下、DNAの分解、ライブラリ調製の条件差、バッチ間差などが最終的なデータにどう現れるかを説明でき、品質指標から異常を検知できること。実験そのものの経験は問いません。データ側から読み取れれば十分です） - Linux環境での作業およびシェルスクリプト、PythonまたはRによるデータ処理 - クラウドストレージ（AWS/GCP/Azure等）を用いた大容量データの管理経験 - 研究者からの依頼を要件として整理し、データ提供の形に落とし込んだ経験 - 検体は有限・不可逆であるという前提を理解していること（データは再計算できますが、検体は戻りません。「たぶん大丈夫」で通さず、差し戻す判断ができること）
  尚可スキル	- メチル化解析データの処理経験 - 解析プラットフォーム・解析パイプラインツールの運用経験 - ワークフロー管理ツールを用いたパイプライン構築の経験 - 受託解析機関とのデータ品質に関する交渉・折衝の経験 - データカタログ、メタデータ標準の設計・導入の経験 - データインテグリティ、適正管理基準（GxP対応）環境でのデータ管理の経験 - 公共データベースへの登録・利用の経験 - 実験室（ウェットラボ）での実務経験

• 基本情報

  単価	～ 500,000 円 /月額
  勤務地	東京都 ※実際の勤務地は応募時にご確認下さい
  契約形態	業務委託
  商流	元請